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Fungos filamentosos são capazes de produzir diversas enzimas, dentre as quais podemos destacar as celulases, lipases e oxi-redutases. As oxi-redutases são enzimas importantes na decomposição de compostos derivados de petróleo, pesticidas e corantes têxteis. Desta forma, o presente trabalho objetivou estudar a capacidade de fungos filamentosos isolados do Planalto das Agulhas Negras, em degradar corantes têxteis por fermentação submersa. 75 linhagens de fungos foram estudadas quanto a degradação de Remazol Brilliant Blue R (RBBR) e Reactive Black 5 (RB-5) nas concentrações de 100 e 200 ppm, em meio Agar Malte por 7 e 14 dias à 28ºC. Após esse período, 5 linhagens de fungos foram selecionadas como promissoras na degradação do corante RBBR e 2 no RB-5. As linhagens I10-8, identificada como Trichoderma sp. e I13-7, identificado como Penicillium sp. foram selecionadas para estudos de fermentação submersa em frascos cônicos (1.000 mL), sendo incubados sob agitação de 180 rpm à 28°C por 7 e 14 dias. Como corantes, foram testados, RB5, Direct Yellow 27 (DY-27) e Reactive Red 120 (RR-120), na concentração de 200 ppm. A linhagem Trichoderma sp. I10-8 foi capaz de remover 20,2% do corante RR-120 do sistema submerso, ao fim de 7 dias enquanto que a linhagem Penicillium sp. I13-7 removeu 100% do corante RB-5 e 18,3% do corante RR-120 ao fim de 7 dias. Os demais corantes não foram possíveis de analisar em função do escurecimento do meio fermentado.