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Os esforços focados na área de modelagem e simulação cromatográfica são essenciais para o avanço dos estudos sobre separação dos enantiômeros do Praziquantel (PZQ: medicamento que atua no tratamento da esquistossomose) de forma mais eficiente e econômica. O presente trabalho tem como abordagem inicial a modelagem de uma coluna cromatográfica, viabilizando o entendimento e a obtenção de conhecimento geral sobre o processo e a posterior análise do comportamento de suas variáveis. O modelo computacional implementado em Fortran será avaliado por resultados experimentais obtidos através das perturbações nas condições de operação. Apesar do processo industrial ser realizado sob a forma de várias colunas integradas em um Leito Móvel Simulado (SMB), os resultados obtidos para uma única coluna são capazes de fornecer a base para a estimação de parâmetros da isoterma de equilíbrio, valores fundamentais para a descrição do processo de separação. O presente trabalho fornece uma boa estimativa para o número de Péclet, sendo este, 1300. Além disso, analisa o efeito de diferentes concentrações iniciais e discute os dados obtidos por simulação considerando aspectos relevantes, como a sobreposição de bandas e limite de detecção dos equipamentos. Com isso, o trabalho apresenta valores de condições de operação satisfatórias para a separação dos enantiômeros do PZQ em uma coluna cromatográfica de 1,0 cm de diâmetro e 25,0 cm de comprimento, cuja fase estacionária é a celulose.